Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp2Q9Z0E6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp2Q9Z0E6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp2Q9Z0E6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp2Q9Z0E6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gbp2Q9Z0E6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gbp2Q9Z0E6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gbp2Q9Z0E6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gbp2Q9Z0E6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gbp2Q9Z0E6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gbp2Q9Z0E6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gbp2Q9Z0E6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms