Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap4s1Q9WVL1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap4s1Q9WVL1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap4s1Q9WVL1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap4s1Q9WVL1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap4s1Q9WVL1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ap4s1Q9WVL1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap4s1Q9WVL1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap4s1Q9WVL1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap4s1Q9WVL1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap4s1Q9WVL1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap4s1Q9WVL1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap4s1Q9WVL1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap4s1Q9WVL1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap4s1Q9WVL1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap4s1Q9WVL1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap4s1Q9WVL1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap4s1Q9WVL1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap4s1Q9WVL1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ap4s1Q9WVL1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap4s1Q9WVL1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap4s1Q9WVL1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap4s1Q9WVL1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap4s1Q9WVL1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap4s1Q9WVL1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap4s1Q9WVL1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap4s1Q9WVL1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap4s1Q9WVL1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap4s1Q9WVL1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ap4s1Q9WVL1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap4s1Q9WVL1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap4s1Q9WVL1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap4s1Q9WVL1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap4s1Q9WVL1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap4s1Q9WVL1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap4s1Q9WVL1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap4s1Q9WVL1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap4s1Q9WVL1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap4s1Q9WVL1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap4s1Q9WVL1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ap4s1Q9WVL1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap4s1Q9WVL1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ap4s1Q9WVL1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap4s1Q9WVL1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap4s1Q9WVL1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap4s1Q9WVL1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap4s1Q9WVL1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap4s1Q9WVL1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ap4s1Q9WVL1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap4s1Q9WVL1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap4s1Q9WVL1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ap4s1Q9WVL1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap4s1Q9WVL1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap4s1Q9WVL1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap4s1Q9WVL1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap4s1Q9WVL1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap4s1Q9WVL1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap4s1Q9WVL1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap4s1Q9WVL1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap4s1Q9WVL1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap4s1Q9WVL1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap4s1Q9WVL1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap4s1Q9WVL1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap4s1Q9WVL1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap4s1Q9WVL1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap4s1Q9WVL1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap4s1Q9WVL1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap4s1Q9WVL1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap4s1Q9WVL1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap4s1Q9WVL1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap4s1Q9WVL1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ap4s1Q9WVL1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap4s1Q9WVL1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap4s1Q9WVL1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap4s1Q9WVL1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap4s1Q9WVL1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap4s1Q9WVL1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap4s1Q9WVL1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap4s1Q9WVL1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap4s1Q9WVL1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap4s1Q9WVL1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap4s1Q9WVL1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap4s1Q9WVL1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms