Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apobec2Q9WV35 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Apobec2Q9WV35 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apobec2Q9WV35 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apobec2Q9WV35 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apobec2Q9WV35 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apobec2Q9WV35 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apobec2Q9WV35 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apobec2Q9WV35 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apobec2Q9WV35 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apobec2Q9WV35 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apobec2Q9WV35 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apobec2Q9WV35 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apobec2Q9WV35 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apobec2Q9WV35 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Apobec2Q9WV35 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apobec2Q9WV35 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apobec2Q9WV35 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apobec2Q9WV35 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apobec2Q9WV35 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apobec2Q9WV35 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Apobec2Q9WV35 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apobec2Q9WV35 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apobec2Q9WV35 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Apobec2Q9WV35 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apobec2Q9WV35 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Apobec2Q9WV35 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apobec2Q9WV35 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms