Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB6

Clcnkb, Chloride channel protein ClC-Kb, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkbQ9WUB6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ClcnkbQ9WUB6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ClcnkbQ9WUB6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ClcnkbQ9WUB6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClcnkbQ9WUB6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClcnkbQ9WUB6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ClcnkbQ9WUB6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClcnkbQ9WUB6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClcnkbQ9WUB6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ClcnkbQ9WUB6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClcnkbQ9WUB6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ClcnkbQ9WUB6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClcnkbQ9WUB6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClcnkbQ9WUB6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClcnkbQ9WUB6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ClcnkbQ9WUB6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ClcnkbQ9WUB6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ClcnkbQ9WUB6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClcnkbQ9WUB6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ClcnkbQ9WUB6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClcnkbQ9WUB6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ClcnkbQ9WUB6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ClcnkbQ9WUB6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ClcnkbQ9WUB6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ClcnkbQ9WUB6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClcnkbQ9WUB6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClcnkbQ9WUB6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClcnkbQ9WUB6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClcnkbQ9WUB6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClcnkbQ9WUB6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClcnkbQ9WUB6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ClcnkbQ9WUB6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ClcnkbQ9WUB6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClcnkbQ9WUB6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClcnkbQ9WUB6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClcnkbQ9WUB6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClcnkbQ9WUB6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClcnkbQ9WUB6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClcnkbQ9WUB6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClcnkbQ9WUB6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClcnkbQ9WUB6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClcnkbQ9WUB6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClcnkbQ9WUB6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClcnkbQ9WUB6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClcnkbQ9WUB6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClcnkbQ9WUB6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClcnkbQ9WUB6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClcnkbQ9WUB6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClcnkbQ9WUB6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ClcnkbQ9WUB6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClcnkbQ9WUB6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClcnkbQ9WUB6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ClcnkbQ9WUB6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClcnkbQ9WUB6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ClcnkbQ9WUB6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClcnkbQ9WUB6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClcnkbQ9WUB6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClcnkbQ9WUB6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClcnkbQ9WUB6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClcnkbQ9WUB6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms