Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU84

Ccs, Copper chaperone for superoxide dismutase, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsQ9WU84 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CcsQ9WU84 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CcsQ9WU84 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CcsQ9WU84 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsQ9WU84 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CcsQ9WU84 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CcsQ9WU84 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CcsQ9WU84 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CcsQ9WU84 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99 ms