Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ptpn4Q9WU22 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn4Q9WU22 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpn4Q9WU22 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn4Q9WU22 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn4Q9WU22 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpn4Q9WU22 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn4Q9WU22 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn4Q9WU22 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpn4Q9WU22 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn4Q9WU22 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn4Q9WU22 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpn4Q9WU22 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptpn4Q9WU22 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn4Q9WU22 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn4Q9WU22 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpn4Q9WU22 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ptpn4Q9WU22 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn4Q9WU22 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn4Q9WU22 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn4Q9WU22 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ptpn4Q9WU22 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ptpn4Q9WU22 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptpn4Q9WU22 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ptpn4Q9WU22 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn4Q9WU22 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ptpn4Q9WU22 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms