Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrf1Q9WU00 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrf1Q9WU00 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrf1Q9WU00 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrf1Q9WU00 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrf1Q9WU00 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrf1Q9WU00 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrf1Q9WU00 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrf1Q9WU00 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrf1Q9WU00 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrf1Q9WU00 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrf1Q9WU00 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrf1Q9WU00 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrf1Q9WU00 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrf1Q9WU00 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrf1Q9WU00 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrf1Q9WU00 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrf1Q9WU00 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrf1Q9WU00 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrf1Q9WU00 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrf1Q9WU00 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrf1Q9WU00 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nrf1Q9WU00 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrf1Q9WU00 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrf1Q9WU00 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nrf1Q9WU00 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nrf1Q9WU00 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nrf1Q9WU00 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrf1Q9WU00 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrf1Q9WU00 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrf1Q9WU00 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrf1Q9WU00 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrf1Q9WU00 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nrf1Q9WU00 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nrf1Q9WU00 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrf1Q9WU00 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrf1Q9WU00 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrf1Q9WU00 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrf1Q9WU00 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrf1Q9WU00 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrf1Q9WU00 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrf1Q9WU00 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrf1Q9WU00 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrf1Q9WU00 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrf1Q9WU00 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nrf1Q9WU00 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrf1Q9WU00 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nrf1Q9WU00 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nrf1Q9WU00 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nrf1Q9WU00 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nrf1Q9WU00 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrf1Q9WU00 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrf1Q9WU00 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nrf1Q9WU00 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nrf1Q9WU00 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nrf1Q9WU00 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms