Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Skp1Q9WTX5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Skp1Q9WTX5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Skp1Q9WTX5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Skp1Q9WTX5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Skp1Q9WTX5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,47■■□□□ 1,35
Skp1Q9WTX5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Skp1Q9WTX5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23,46■■□□□ 1,35
Skp1Q9WTX5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Skp1Q9WTX5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Skp1Q9WTX5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Skp1Q9WTX5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Skp1Q9WTX5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Skp1Q9WTX5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Skp1Q9WTX5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23,37■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Skp1Q9WTX5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,33■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23,27■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,27■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Skp1Q9WTX5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,31
Skp1Q9WTX5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Skp1Q9WTX5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Skp1Q9WTX5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23,25■■□□□ 1,31
Skp1Q9WTX5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Skp1Q9WTX5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Skp1Q9WTX5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Skp1Q9WTX5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Skp1Q9WTX5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Skp1Q9WTX5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Skp1Q9WTX5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Skp1Q9WTX5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Skp1Q9WTX5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Skp1Q9WTX5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Skp1Q9WTX5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Skp1Q9WTX5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Skp1Q9WTX5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,17■■□□□ 1,3
Skp1Q9WTX5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Skp1Q9WTX5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Skp1Q9WTX5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Skp1Q9WTX5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Skp1Q9WTX5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Skp1Q9WTX5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Skp1Q9WTX5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Skp1Q9WTX5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23,13■■□□□ 1,29
Skp1Q9WTX5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Skp1Q9WTX5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Skp1Q9WTX5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Skp1Q9WTX5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Skp1Q9WTX5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Skp1Q9WTX5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Skp1Q9WTX5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Skp1Q9WTX5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Skp1Q9WTX5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Skp1Q9WTX5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Skp1Q9WTX5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23,07■■□□□ 1,28
Skp1Q9WTX5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Skp1Q9WTX5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Skp1Q9WTX5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Skp1Q9WTX5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Skp1Q9WTX5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Skp1Q9WTX5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Skp1Q9WTX5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,8 ms