Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phf2Q9WTU0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phf2Q9WTU0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phf2Q9WTU0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phf2Q9WTU0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phf2Q9WTU0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phf2Q9WTU0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phf2Q9WTU0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phf2Q9WTU0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phf2Q9WTU0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phf2Q9WTU0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phf2Q9WTU0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phf2Q9WTU0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phf2Q9WTU0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phf2Q9WTU0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phf2Q9WTU0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phf2Q9WTU0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Phf2Q9WTU0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phf2Q9WTU0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phf2Q9WTU0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Phf2Q9WTU0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Phf2Q9WTU0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phf2Q9WTU0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phf2Q9WTU0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Phf2Q9WTU0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Phf2Q9WTU0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Phf2Q9WTU0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Phf2Q9WTU0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Phf2Q9WTU0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phf2Q9WTU0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phf2Q9WTU0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phf2Q9WTU0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phf2Q9WTU0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Phf2Q9WTU0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phf2Q9WTU0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Phf2Q9WTU0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Phf2Q9WTU0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Phf2Q9WTU0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Phf2Q9WTU0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phf2Q9WTU0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Phf2Q9WTU0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phf2Q9WTU0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Phf2Q9WTU0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phf2Q9WTU0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phf2Q9WTU0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phf2Q9WTU0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phf2Q9WTU0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Phf2Q9WTU0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phf2Q9WTU0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Phf2Q9WTU0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Phf2Q9WTU0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Phf2Q9WTU0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phf2Q9WTU0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phf2Q9WTU0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Phf2Q9WTU0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phf2Q9WTU0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Phf2Q9WTU0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf2Q9WTU0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Phf2Q9WTU0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms