Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc2Q9R244 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc2Q9R244 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpc2Q9R244 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trpc2Q9R244 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpc2Q9R244 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpc2Q9R244 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpc2Q9R244 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpc2Q9R244 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpc2Q9R244 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpc2Q9R244 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trpc2Q9R244 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpc2Q9R244 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trpc2Q9R244 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpc2Q9R244 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpc2Q9R244 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpc2Q9R244 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trpc2Q9R244 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trpc2Q9R244 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpc2Q9R244 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpc2Q9R244 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc2Q9R244 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc2Q9R244 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpc2Q9R244 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc2Q9R244 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpc2Q9R244 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpc2Q9R244 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms