Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Htra1Q9R118 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Htra1Q9R118 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htra1Q9R118 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htra1Q9R118 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htra1Q9R118 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htra1Q9R118 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htra1Q9R118 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htra1Q9R118 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htra1Q9R118 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htra1Q9R118 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htra1Q9R118 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htra1Q9R118 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htra1Q9R118 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Htra1Q9R118 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Htra1Q9R118 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htra1Q9R118 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htra1Q9R118 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htra1Q9R118 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htra1Q9R118 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htra1Q9R118 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htra1Q9R118 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htra1Q9R118 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htra1Q9R118 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htra1Q9R118 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms