Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H0

Acox1, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acox1Q9R0H0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Acox1Q9R0H0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acox1Q9R0H0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acox1Q9R0H0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acox1Q9R0H0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acox1Q9R0H0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Acox1Q9R0H0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acox1Q9R0H0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acox1Q9R0H0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acox1Q9R0H0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acox1Q9R0H0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Acox1Q9R0H0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Acox1Q9R0H0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acox1Q9R0H0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acox1Q9R0H0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Acox1Q9R0H0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Acox1Q9R0H0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acox1Q9R0H0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acox1Q9R0H0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Acox1Q9R0H0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Acox1Q9R0H0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Acox1Q9R0H0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acox1Q9R0H0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acox1Q9R0H0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Acox1Q9R0H0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acox1Q9R0H0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Acox1Q9R0H0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Acox1Q9R0H0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Acox1Q9R0H0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acox1Q9R0H0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acox1Q9R0H0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acox1Q9R0H0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Acox1Q9R0H0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acox1Q9R0H0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Acox1Q9R0H0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms