Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Plod1Q9R0E2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Plod1Q9R0E2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Plod1Q9R0E2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Plod1Q9R0E2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Plod1Q9R0E2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Plod1Q9R0E2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plod1Q9R0E2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plod1Q9R0E2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plod1Q9R0E2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Plod1Q9R0E2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Plod1Q9R0E2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Plod1Q9R0E2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Plod1Q9R0E2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Plod1Q9R0E2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Plod1Q9R0E2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Plod1Q9R0E2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Plod1Q9R0E2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Plod1Q9R0E2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Plod1Q9R0E2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Plod1Q9R0E2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Plod1Q9R0E2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Plod1Q9R0E2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Plod1Q9R0E2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Plod1Q9R0E2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms