Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Nek3Q9R0A5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nek3Q9R0A5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nek3Q9R0A5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Nek3Q9R0A5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nek3Q9R0A5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nek3Q9R0A5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nek3Q9R0A5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nek3Q9R0A5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nek3Q9R0A5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nek3Q9R0A5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nek3Q9R0A5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nek3Q9R0A5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nek3Q9R0A5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nek3Q9R0A5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nek3Q9R0A5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nek3Q9R0A5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nek3Q9R0A5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nek3Q9R0A5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nek3Q9R0A5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek3Q9R0A5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek3Q9R0A5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek3Q9R0A5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek3Q9R0A5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nek3Q9R0A5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nek3Q9R0A5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nek3Q9R0A5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nek3Q9R0A5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek3Q9R0A5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nek3Q9R0A5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nek3Q9R0A5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nek3Q9R0A5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nek3Q9R0A5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nek3Q9R0A5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nek3Q9R0A5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nek3Q9R0A5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nek3Q9R0A5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nek3Q9R0A5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nek3Q9R0A5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nek3Q9R0A5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nek3Q9R0A5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nek3Q9R0A5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Nek3Q9R0A5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nek3Q9R0A5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nek3Q9R0A5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nek3Q9R0A5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nek3Q9R0A5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nek3Q9R0A5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nek3Q9R0A5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nek3Q9R0A5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek3Q9R0A5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek3Q9R0A5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek3Q9R0A5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nek3Q9R0A5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nek3Q9R0A5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nek3Q9R0A5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nek3Q9R0A5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nek3Q9R0A5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nek3Q9R0A5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nek3Q9R0A5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nek3Q9R0A5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nek3Q9R0A5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nek3Q9R0A5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nek3Q9R0A5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nek3Q9R0A5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nek3Q9R0A5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nek3Q9R0A5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nek3Q9R0A5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nek3Q9R0A5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nek3Q9R0A5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nek3Q9R0A5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nek3Q9R0A5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nek3Q9R0A5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nek3Q9R0A5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms