Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BcamQ9R069 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BcamQ9R069 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BcamQ9R069 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BcamQ9R069 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BcamQ9R069 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BcamQ9R069 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BcamQ9R069 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BcamQ9R069 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BcamQ9R069 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BcamQ9R069 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BcamQ9R069 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BcamQ9R069 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BcamQ9R069 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BcamQ9R069 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BcamQ9R069 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BcamQ9R069 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BcamQ9R069 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BcamQ9R069 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BcamQ9R069 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BcamQ9R069 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BcamQ9R069 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BcamQ9R069 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BcamQ9R069 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BcamQ9R069 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BcamQ9R069 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BcamQ9R069 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BcamQ9R069 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BcamQ9R069 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BcamQ9R069 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BcamQ9R069 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BcamQ9R069 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BcamQ9R069 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BcamQ9R069 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BcamQ9R069 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BcamQ9R069 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BcamQ9R069 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BcamQ9R069 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BcamQ9R069 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BcamQ9R069 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BcamQ9R069 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BcamQ9R069 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BcamQ9R069 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BcamQ9R069 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BcamQ9R069 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BcamQ9R069 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BcamQ9R069 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BcamQ9R069 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BcamQ9R069 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BcamQ9R069 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BcamQ9R069 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BcamQ9R069 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BcamQ9R069 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BcamQ9R069 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BcamQ9R069 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BcamQ9R069 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BcamQ9R069 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BcamQ9R069 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BcamQ9R069 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BcamQ9R069 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BcamQ9R069 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BcamQ9R069 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BcamQ9R069 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BcamQ9R069 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BcamQ9R069 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BcamQ9R069 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BcamQ9R069 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BcamQ9R069 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BcamQ9R069 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BcamQ9R069 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BcamQ9R069 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BcamQ9R069 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BcamQ9R069 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BcamQ9R069 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BcamQ9R069 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BcamQ9R069 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BcamQ9R069 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BcamQ9R069 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BcamQ9R069 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BcamQ9R069 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BcamQ9R069 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BcamQ9R069 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BcamQ9R069 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BcamQ9R069 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BcamQ9R069 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms