Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ndrg3Q9QYF9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndrg3Q9QYF9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ndrg3Q9QYF9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ndrg3Q9QYF9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ndrg3Q9QYF9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndrg3Q9QYF9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ndrg3Q9QYF9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndrg3Q9QYF9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndrg3Q9QYF9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndrg3Q9QYF9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg3Q9QYF9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg3Q9QYF9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ndrg3Q9QYF9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndrg3Q9QYF9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ndrg3Q9QYF9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ndrg3Q9QYF9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ndrg3Q9QYF9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ndrg3Q9QYF9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndrg3Q9QYF9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ndrg3Q9QYF9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ndrg3Q9QYF9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndrg3Q9QYF9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndrg3Q9QYF9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndrg3Q9QYF9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndrg3Q9QYF9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndrg3Q9QYF9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndrg3Q9QYF9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndrg3Q9QYF9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndrg3Q9QYF9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndrg3Q9QYF9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndrg3Q9QYF9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndrg3Q9QYF9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndrg3Q9QYF9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndrg3Q9QYF9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms