Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snai3Q9QY31 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snai3Q9QY31 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snai3Q9QY31 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Snai3Q9QY31 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Snai3Q9QY31 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Snai3Q9QY31 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai3Q9QY31 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Snai3Q9QY31 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai3Q9QY31 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai3Q9QY31 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai3Q9QY31 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Snai3Q9QY31 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai3Q9QY31 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Snai3Q9QY31 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai3Q9QY31 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snai3Q9QY31 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snai3Q9QY31 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snai3Q9QY31 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms