Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nufip1Q9QXX8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nufip1Q9QXX8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nufip1Q9QXX8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nufip1Q9QXX8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nufip1Q9QXX8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nufip1Q9QXX8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nufip1Q9QXX8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nufip1Q9QXX8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nufip1Q9QXX8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nufip1Q9QXX8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nufip1Q9QXX8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nufip1Q9QXX8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nufip1Q9QXX8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nufip1Q9QXX8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nufip1Q9QXX8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nufip1Q9QXX8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nufip1Q9QXX8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nufip1Q9QXX8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nufip1Q9QXX8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nufip1Q9QXX8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nufip1Q9QXX8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nufip1Q9QXX8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nufip1Q9QXX8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nufip1Q9QXX8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nufip1Q9QXX8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nufip1Q9QXX8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nufip1Q9QXX8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nufip1Q9QXX8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nufip1Q9QXX8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nufip1Q9QXX8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nufip1Q9QXX8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nufip1Q9QXX8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nufip1Q9QXX8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nufip1Q9QXX8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nufip1Q9QXX8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nufip1Q9QXX8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nufip1Q9QXX8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nufip1Q9QXX8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nufip1Q9QXX8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nufip1Q9QXX8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nufip1Q9QXX8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nufip1Q9QXX8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nufip1Q9QXX8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nufip1Q9QXX8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nufip1Q9QXX8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nufip1Q9QXX8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nufip1Q9QXX8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nufip1Q9QXX8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nufip1Q9QXX8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nufip1Q9QXX8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nufip1Q9QXX8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nufip1Q9QXX8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nufip1Q9QXX8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nufip1Q9QXX8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms