Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fscn3Q9QXW4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fscn3Q9QXW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fscn3Q9QXW4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fscn3Q9QXW4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fscn3Q9QXW4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fscn3Q9QXW4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fscn3Q9QXW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fscn3Q9QXW4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn3Q9QXW4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fscn3Q9QXW4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fscn3Q9QXW4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fscn3Q9QXW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fscn3Q9QXW4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fscn3Q9QXW4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fscn3Q9QXW4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fscn3Q9QXW4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fscn3Q9QXW4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fscn3Q9QXW4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fscn3Q9QXW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fscn3Q9QXW4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fscn3Q9QXW4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fscn3Q9QXW4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms