Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kifc1Q9QWT9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kifc1Q9QWT9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kifc1Q9QWT9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kifc1Q9QWT9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kifc1Q9QWT9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kifc1Q9QWT9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kifc1Q9QWT9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kifc1Q9QWT9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kifc1Q9QWT9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kifc1Q9QWT9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kifc1Q9QWT9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kifc1Q9QWT9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kifc1Q9QWT9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Kifc1Q9QWT9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kifc1Q9QWT9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Kifc1Q9QWT9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Kifc1Q9QWT9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kifc1Q9QWT9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kifc1Q9QWT9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kifc1Q9QWT9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kifc1Q9QWT9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kifc1Q9QWT9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kifc1Q9QWT9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kifc1Q9QWT9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kifc1Q9QWT9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kifc1Q9QWT9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kifc1Q9QWT9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kifc1Q9QWT9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kifc1Q9QWT9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kifc1Q9QWT9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kifc1Q9QWT9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kifc1Q9QWT9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kifc1Q9QWT9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kifc1Q9QWT9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kifc1Q9QWT9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kifc1Q9QWT9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kifc1Q9QWT9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kifc1Q9QWT9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kifc1Q9QWT9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kifc1Q9QWT9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kifc1Q9QWT9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kifc1Q9QWT9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kifc1Q9QWT9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kifc1Q9QWT9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kifc1Q9QWT9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kifc1Q9QWT9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kifc1Q9QWT9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kifc1Q9QWT9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kifc1Q9QWT9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kifc1Q9QWT9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kifc1Q9QWT9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kifc1Q9QWT9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Kifc1Q9QWT9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kifc1Q9QWT9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms