Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mid2Q9QUS6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mid2Q9QUS6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mid2Q9QUS6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mid2Q9QUS6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mid2Q9QUS6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mid2Q9QUS6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mid2Q9QUS6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mid2Q9QUS6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mid2Q9QUS6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mid2Q9QUS6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mid2Q9QUS6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mid2Q9QUS6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mid2Q9QUS6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mid2Q9QUS6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mid2Q9QUS6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mid2Q9QUS6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mid2Q9QUS6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mid2Q9QUS6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mid2Q9QUS6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mid2Q9QUS6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mid2Q9QUS6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mid2Q9QUS6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mid2Q9QUS6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mid2Q9QUS6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mid2Q9QUS6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mid2Q9QUS6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mid2Q9QUS6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mid2Q9QUS6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mid2Q9QUS6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms