Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gkap1Q9JMB0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gkap1Q9JMB0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gkap1Q9JMB0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gkap1Q9JMB0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gkap1Q9JMB0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gkap1Q9JMB0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gkap1Q9JMB0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gkap1Q9JMB0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gkap1Q9JMB0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gkap1Q9JMB0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gkap1Q9JMB0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gkap1Q9JMB0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gkap1Q9JMB0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gkap1Q9JMB0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gkap1Q9JMB0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gkap1Q9JMB0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gkap1Q9JMB0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gkap1Q9JMB0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gkap1Q9JMB0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gkap1Q9JMB0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gkap1Q9JMB0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gkap1Q9JMB0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gkap1Q9JMB0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gkap1Q9JMB0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gkap1Q9JMB0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gkap1Q9JMB0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gkap1Q9JMB0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms