Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Arl6ip1Q9JKW0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arl6ip1Q9JKW0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip1Q9JKW0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip1Q9JKW0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arl6ip1Q9JKW0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arl6ip1Q9JKW0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arl6ip1Q9JKW0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arl6ip1Q9JKW0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl6ip1Q9JKW0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl6ip1Q9JKW0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arl6ip1Q9JKW0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arl6ip1Q9JKW0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arl6ip1Q9JKW0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arl6ip1Q9JKW0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arl6ip1Q9JKW0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arl6ip1Q9JKW0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl6ip1Q9JKW0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arl6ip1Q9JKW0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Arl6ip1Q9JKW0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arl6ip1Q9JKW0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arl6ip1Q9JKW0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl6ip1Q9JKW0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl6ip1Q9JKW0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arl6ip1Q9JKW0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arl6ip1Q9JKW0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl6ip1Q9JKW0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl6ip1Q9JKW0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arl6ip1Q9JKW0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arl6ip1Q9JKW0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arl6ip1Q9JKW0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms