Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Irx5Q9JKQ4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irx5Q9JKQ4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Irx5Q9JKQ4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Irx5Q9JKQ4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Irx5Q9JKQ4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Irx5Q9JKQ4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Irx5Q9JKQ4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Irx5Q9JKQ4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Irx5Q9JKQ4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Irx5Q9JKQ4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irx5Q9JKQ4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Irx5Q9JKQ4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irx5Q9JKQ4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Irx5Q9JKQ4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Irx5Q9JKQ4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Irx5Q9JKQ4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Irx5Q9JKQ4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Irx5Q9JKQ4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Irx5Q9JKQ4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Irx5Q9JKQ4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Irx5Q9JKQ4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Irx5Q9JKQ4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Irx5Q9JKQ4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Irx5Q9JKQ4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Irx5Q9JKQ4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Irx5Q9JKQ4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Irx5Q9JKQ4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Irx5Q9JKQ4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx5Q9JKQ4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Irx5Q9JKQ4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx5Q9JKQ4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx5Q9JKQ4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irx5Q9JKQ4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irx5Q9JKQ4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irx5Q9JKQ4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irx5Q9JKQ4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irx5Q9JKQ4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irx5Q9JKQ4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx5Q9JKQ4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx5Q9JKQ4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx5Q9JKQ4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx5Q9JKQ4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irx5Q9JKQ4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx5Q9JKQ4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx5Q9JKQ4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Irx5Q9JKQ4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx5Q9JKQ4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irx5Q9JKQ4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx5Q9JKQ4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx5Q9JKQ4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx5Q9JKQ4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx5Q9JKQ4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx5Q9JKQ4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx5Q9JKQ4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx5Q9JKQ4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Irx5Q9JKQ4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx5Q9JKQ4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx5Q9JKQ4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx5Q9JKQ4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx5Q9JKQ4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx5Q9JKQ4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irx5Q9JKQ4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irx5Q9JKQ4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irx5Q9JKQ4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.5 ms