Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
AtrQ9JKK8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AtrQ9JKK8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AtrQ9JKK8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AtrQ9JKK8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AtrQ9JKK8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AtrQ9JKK8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
AtrQ9JKK8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AtrQ9JKK8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AtrQ9JKK8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AtrQ9JKK8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AtrQ9JKK8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AtrQ9JKK8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrQ9JKK8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrQ9JKK8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrQ9JKK8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrQ9JKK8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrQ9JKK8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrQ9JKK8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrQ9JKK8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrQ9JKK8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrQ9JKK8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AtrQ9JKK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AtrQ9JKK8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AtrQ9JKK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AtrQ9JKK8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AtrQ9JKK8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AtrQ9JKK8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AtrQ9JKK8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AtrQ9JKK8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AtrQ9JKK8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AtrQ9JKK8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AtrQ9JKK8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AtrQ9JKK8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
AtrQ9JKK8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AtrQ9JKK8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AtrQ9JKK8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AtrQ9JKK8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
AtrQ9JKK8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
AtrQ9JKK8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
AtrQ9JKK8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AtrQ9JKK8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms