Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ap4m1Q9JKC7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ap4m1Q9JKC7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ap4m1Q9JKC7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ap4m1Q9JKC7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ap4m1Q9JKC7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap4m1Q9JKC7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms