Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd3Q9JJY3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smpd3Q9JJY3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd3Q9JJY3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd3Q9JJY3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpd3Q9JJY3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpd3Q9JJY3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpd3Q9JJY3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd3Q9JJY3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd3Q9JJY3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd3Q9JJY3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd3Q9JJY3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd3Q9JJY3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd3Q9JJY3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd3Q9JJY3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smpd3Q9JJY3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smpd3Q9JJY3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpd3Q9JJY3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smpd3Q9JJY3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd3Q9JJY3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd3Q9JJY3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smpd3Q9JJY3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpd3Q9JJY3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smpd3Q9JJY3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd3Q9JJY3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd3Q9JJY3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smpd3Q9JJY3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smpd3Q9JJY3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smpd3Q9JJY3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smpd3Q9JJY3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms