Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nrip3Q9JJR9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nrip3Q9JJR9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrip3Q9JJR9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrip3Q9JJR9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nrip3Q9JJR9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrip3Q9JJR9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrip3Q9JJR9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nrip3Q9JJR9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrip3Q9JJR9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nrip3Q9JJR9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrip3Q9JJR9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrip3Q9JJR9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nrip3Q9JJR9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nrip3Q9JJR9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrip3Q9JJR9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrip3Q9JJR9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nrip3Q9JJR9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrip3Q9JJR9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrip3Q9JJR9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrip3Q9JJR9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nrip3Q9JJR9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrip3Q9JJR9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrip3Q9JJR9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nrip3Q9JJR9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nrip3Q9JJR9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nrip3Q9JJR9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nrip3Q9JJR9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nrip3Q9JJR9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrip3Q9JJR9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nrip3Q9JJR9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip3Q9JJR9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nrip3Q9JJR9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrip3Q9JJR9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrip3Q9JJR9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrip3Q9JJR9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nrip3Q9JJR9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nrip3Q9JJR9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrip3Q9JJR9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nrip3Q9JJR9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrip3Q9JJR9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrip3Q9JJR9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrip3Q9JJR9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrip3Q9JJR9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrip3Q9JJR9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrip3Q9JJR9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrip3Q9JJR9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrip3Q9JJR9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrip3Q9JJR9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrip3Q9JJR9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrip3Q9JJR9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrip3Q9JJR9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms