Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ59

Abcb9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb9Q9JJ59 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb9Q9JJ59 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb9Q9JJ59 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb9Q9JJ59 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb9Q9JJ59 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb9Q9JJ59 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abcb9Q9JJ59 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcb9Q9JJ59 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcb9Q9JJ59 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcb9Q9JJ59 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcb9Q9JJ59 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abcb9Q9JJ59 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb9Q9JJ59 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcb9Q9JJ59 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb9Q9JJ59 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcb9Q9JJ59 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb9Q9JJ59 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb9Q9JJ59 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb9Q9JJ59 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcb9Q9JJ59 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb9Q9JJ59 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcb9Q9JJ59 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb9Q9JJ59 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abcb9Q9JJ59 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcb9Q9JJ59 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcb9Q9JJ59 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb9Q9JJ59 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb9Q9JJ59 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcb9Q9JJ59 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb9Q9JJ59 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcb9Q9JJ59 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcb9Q9JJ59 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb9Q9JJ59 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcb9Q9JJ59 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcb9Q9JJ59 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb9Q9JJ59 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcb9Q9JJ59 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb9Q9JJ59 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb9Q9JJ59 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcb9Q9JJ59 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms