Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Copb1Q9JIF7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Copb1Q9JIF7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Copb1Q9JIF7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Copb1Q9JIF7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Copb1Q9JIF7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Copb1Q9JIF7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Copb1Q9JIF7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Copb1Q9JIF7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Copb1Q9JIF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Copb1Q9JIF7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Copb1Q9JIF7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Copb1Q9JIF7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Copb1Q9JIF7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Copb1Q9JIF7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Copb1Q9JIF7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Copb1Q9JIF7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Copb1Q9JIF7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Copb1Q9JIF7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Copb1Q9JIF7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Copb1Q9JIF7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Copb1Q9JIF7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Copb1Q9JIF7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Copb1Q9JIF7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Copb1Q9JIF7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Copb1Q9JIF7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Copb1Q9JIF7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Copb1Q9JIF7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Copb1Q9JIF7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Copb1Q9JIF7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Copb1Q9JIF7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Copb1Q9JIF7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Copb1Q9JIF7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Copb1Q9JIF7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Copb1Q9JIF7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Copb1Q9JIF7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Copb1Q9JIF7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Copb1Q9JIF7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Copb1Q9JIF7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Copb1Q9JIF7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Copb1Q9JIF7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Copb1Q9JIF7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Copb1Q9JIF7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Copb1Q9JIF7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Copb1Q9JIF7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Copb1Q9JIF7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Copb1Q9JIF7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Copb1Q9JIF7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Copb1Q9JIF7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Copb1Q9JIF7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Copb1Q9JIF7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Copb1Q9JIF7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Copb1Q9JIF7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Copb1Q9JIF7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Copb1Q9JIF7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Copb1Q9JIF7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Copb1Q9JIF7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Copb1Q9JIF7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Copb1Q9JIF7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Copb1Q9JIF7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Copb1Q9JIF7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Copb1Q9JIF7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Copb1Q9JIF7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Copb1Q9JIF7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Copb1Q9JIF7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Copb1Q9JIF7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Copb1Q9JIF7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms