Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2ird1Q9JI57 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gtf2ird1Q9JI57 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gtf2ird1Q9JI57 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gtf2ird1Q9JI57 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2ird1Q9JI57 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gtf2ird1Q9JI57 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2ird1Q9JI57 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2ird1Q9JI57 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gtf2ird1Q9JI57 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2ird1Q9JI57 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf2ird1Q9JI57 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf2ird1Q9JI57 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gtf2ird1Q9JI57 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf2ird1Q9JI57 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf2ird1Q9JI57 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf2ird1Q9JI57 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2ird1Q9JI57 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2ird1Q9JI57 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf2ird1Q9JI57 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf2ird1Q9JI57 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf2ird1Q9JI57 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2ird1Q9JI57 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf2ird1Q9JI57 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf2ird1Q9JI57 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gtf2ird1Q9JI57 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms