Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pus3Q9JI38 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pus3Q9JI38 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pus3Q9JI38 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pus3Q9JI38 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Pus3Q9JI38 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pus3Q9JI38 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Pus3Q9JI38 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pus3Q9JI38 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pus3Q9JI38 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pus3Q9JI38 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pus3Q9JI38 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pus3Q9JI38 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pus3Q9JI38 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pus3Q9JI38 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pus3Q9JI38 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pus3Q9JI38 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pus3Q9JI38 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
Pus3Q9JI38 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Pus3Q9JI38 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pus3Q9JI38 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pus3Q9JI38 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pus3Q9JI38 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pus3Q9JI38 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pus3Q9JI38 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pus3Q9JI38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pus3Q9JI38 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pus3Q9JI38 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pus3Q9JI38 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pus3Q9JI38 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pus3Q9JI38 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pus3Q9JI38 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pus3Q9JI38 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pus3Q9JI38 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pus3Q9JI38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pus3Q9JI38 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pus3Q9JI38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pus3Q9JI38 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pus3Q9JI38 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pus3Q9JI38 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pus3Q9JI38 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pus3Q9JI38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Pus3Q9JI38 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Pus3Q9JI38 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pus3Q9JI38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pus3Q9JI38 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pus3Q9JI38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Pus3Q9JI38 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pus3Q9JI38 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pus3Q9JI38 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pus3Q9JI38 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Pus3Q9JI38 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pus3Q9JI38 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pus3Q9JI38 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pus3Q9JI38 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pus3Q9JI38 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pus3Q9JI38 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pus3Q9JI38 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pus3Q9JI38 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms