Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tcirg1Q9JHF5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tcirg1Q9JHF5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tcirg1Q9JHF5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tcirg1Q9JHF5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tcirg1Q9JHF5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tcirg1Q9JHF5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tcirg1Q9JHF5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tcirg1Q9JHF5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tcirg1Q9JHF5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Tcirg1Q9JHF5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tcirg1Q9JHF5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tcirg1Q9JHF5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcirg1Q9JHF5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcirg1Q9JHF5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcirg1Q9JHF5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tcirg1Q9JHF5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tcirg1Q9JHF5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tcirg1Q9JHF5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcirg1Q9JHF5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcirg1Q9JHF5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tcirg1Q9JHF5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcirg1Q9JHF5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tcirg1Q9JHF5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tcirg1Q9JHF5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tcirg1Q9JHF5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tcirg1Q9JHF5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcirg1Q9JHF5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcirg1Q9JHF5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcirg1Q9JHF5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tcirg1Q9JHF5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tcirg1Q9JHF5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tcirg1Q9JHF5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tcirg1Q9JHF5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tcirg1Q9JHF5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tcirg1Q9JHF5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tcirg1Q9JHF5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tcirg1Q9JHF5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tcirg1Q9JHF5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tcirg1Q9JHF5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tcirg1Q9JHF5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcirg1Q9JHF5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcirg1Q9JHF5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tcirg1Q9JHF5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcirg1Q9JHF5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tcirg1Q9JHF5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tcirg1Q9JHF5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcirg1Q9JHF5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcirg1Q9JHF5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcirg1Q9JHF5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tcirg1Q9JHF5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tcirg1Q9JHF5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcirg1Q9JHF5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcirg1Q9JHF5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcirg1Q9JHF5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcirg1Q9JHF5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcirg1Q9JHF5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms