Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ush1cQ9ES64 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ush1cQ9ES64 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ush1cQ9ES64 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ush1cQ9ES64 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ush1cQ9ES64 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ush1cQ9ES64 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ush1cQ9ES64 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ush1cQ9ES64 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ush1cQ9ES64 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ush1cQ9ES64 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ush1cQ9ES64 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ush1cQ9ES64 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ush1cQ9ES64 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ush1cQ9ES64 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ush1cQ9ES64 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ush1cQ9ES64 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ush1cQ9ES64 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ush1cQ9ES64 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ush1cQ9ES64 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ush1cQ9ES64 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ush1cQ9ES64 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ush1cQ9ES64 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ush1cQ9ES64 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ush1cQ9ES64 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ush1cQ9ES64 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ush1cQ9ES64 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ush1cQ9ES64 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ush1cQ9ES64 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ush1cQ9ES64 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ush1cQ9ES64 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ush1cQ9ES64 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ush1cQ9ES64 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ush1cQ9ES64 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ush1cQ9ES64 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ush1cQ9ES64 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ush1cQ9ES64 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ush1cQ9ES64 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ush1cQ9ES64 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ush1cQ9ES64 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ush1cQ9ES64 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ush1cQ9ES64 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ush1cQ9ES64 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ush1cQ9ES64 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ush1cQ9ES64 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ush1cQ9ES64 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ush1cQ9ES64 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ush1cQ9ES64 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ush1cQ9ES64 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ush1cQ9ES64 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ush1cQ9ES64 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ush1cQ9ES64 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ush1cQ9ES64 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ush1cQ9ES64 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ush1cQ9ES64 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ush1cQ9ES64 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ush1cQ9ES64 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ush1cQ9ES64 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ush1cQ9ES64 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ush1cQ9ES64 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ush1cQ9ES64 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ush1cQ9ES64 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ush1cQ9ES64 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ush1cQ9ES64 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ush1cQ9ES64 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ush1cQ9ES64 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ush1cQ9ES64 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ush1cQ9ES64 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ush1cQ9ES64 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ush1cQ9ES64 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ush1cQ9ES64 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ush1cQ9ES64 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ush1cQ9ES64 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ush1cQ9ES64 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ush1cQ9ES64 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ush1cQ9ES64 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ush1cQ9ES64 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms