Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR1

Ndel1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndel1Q9ERR1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndel1Q9ERR1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ndel1Q9ERR1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndel1Q9ERR1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ndel1Q9ERR1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndel1Q9ERR1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndel1Q9ERR1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndel1Q9ERR1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndel1Q9ERR1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndel1Q9ERR1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndel1Q9ERR1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndel1Q9ERR1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndel1Q9ERR1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndel1Q9ERR1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndel1Q9ERR1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndel1Q9ERR1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndel1Q9ERR1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndel1Q9ERR1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndel1Q9ERR1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndel1Q9ERR1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndel1Q9ERR1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndel1Q9ERR1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndel1Q9ERR1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndel1Q9ERR1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndel1Q9ERR1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndel1Q9ERR1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms