Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tfip11Q9ERA6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tfip11Q9ERA6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tfip11Q9ERA6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tfip11Q9ERA6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tfip11Q9ERA6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tfip11Q9ERA6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tfip11Q9ERA6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tfip11Q9ERA6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tfip11Q9ERA6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tfip11Q9ERA6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tfip11Q9ERA6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tfip11Q9ERA6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tfip11Q9ERA6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tfip11Q9ERA6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tfip11Q9ERA6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tfip11Q9ERA6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tfip11Q9ERA6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tfip11Q9ERA6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tfip11Q9ERA6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tfip11Q9ERA6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tfip11Q9ERA6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tfip11Q9ERA6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tfip11Q9ERA6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tfip11Q9ERA6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tfip11Q9ERA6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tfip11Q9ERA6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tfip11Q9ERA6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tfip11Q9ERA6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tfip11Q9ERA6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tfip11Q9ERA6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tfip11Q9ERA6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tfip11Q9ERA6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tfip11Q9ERA6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tfip11Q9ERA6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tfip11Q9ERA6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tfip11Q9ERA6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tfip11Q9ERA6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tfip11Q9ERA6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tfip11Q9ERA6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tfip11Q9ERA6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tfip11Q9ERA6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tfip11Q9ERA6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Tfip11Q9ERA6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tfip11Q9ERA6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tfip11Q9ERA6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tfip11Q9ERA6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tfip11Q9ERA6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tfip11Q9ERA6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tfip11Q9ERA6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tfip11Q9ERA6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tfip11Q9ERA6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tfip11Q9ERA6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tfip11Q9ERA6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Tfip11Q9ERA6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tfip11Q9ERA6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms