Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tor1aQ9ER39 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tor1aQ9ER39 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tor1aQ9ER39 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tor1aQ9ER39 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tor1aQ9ER39 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tor1aQ9ER39 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tor1aQ9ER39 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tor1aQ9ER39 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tor1aQ9ER39 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tor1aQ9ER39 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tor1aQ9ER39 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tor1aQ9ER39 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tor1aQ9ER39 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tor1aQ9ER39 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tor1aQ9ER39 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tor1aQ9ER39 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tor1aQ9ER39 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tor1aQ9ER39 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tor1aQ9ER39 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tor1aQ9ER39 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tor1aQ9ER39 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tor1aQ9ER39 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tor1aQ9ER39 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tor1aQ9ER39 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tor1aQ9ER39 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tor1aQ9ER39 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tor1aQ9ER39 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tor1aQ9ER39 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tor1aQ9ER39 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tor1aQ9ER39 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tor1aQ9ER39 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tor1aQ9ER39 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tor1aQ9ER39 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tor1aQ9ER39 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tor1aQ9ER39 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tor1aQ9ER39 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tor1aQ9ER39 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tor1aQ9ER39 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tor1aQ9ER39 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms