Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox9Q9EQM5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhox9Q9EQM5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhox9Q9EQM5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhox9Q9EQM5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhox9Q9EQM5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhox9Q9EQM5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhox9Q9EQM5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox9Q9EQM5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox9Q9EQM5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox9Q9EQM5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox9Q9EQM5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox9Q9EQM5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox9Q9EQM5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox9Q9EQM5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox9Q9EQM5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox9Q9EQM5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox9Q9EQM5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox9Q9EQM5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox9Q9EQM5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox9Q9EQM5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox9Q9EQM5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox9Q9EQM5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox9Q9EQM5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox9Q9EQM5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rhox9Q9EQM5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rhox9Q9EQM5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rhox9Q9EQM5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rhox9Q9EQM5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms