Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ31

Lpar3, Lysophosphatidic acid receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpar3Q9EQ31 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lpar3Q9EQ31 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lpar3Q9EQ31 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lpar3Q9EQ31 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lpar3Q9EQ31 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lpar3Q9EQ31 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lpar3Q9EQ31 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lpar3Q9EQ31 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lpar3Q9EQ31 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lpar3Q9EQ31 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lpar3Q9EQ31 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lpar3Q9EQ31 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lpar3Q9EQ31 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lpar3Q9EQ31 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lpar3Q9EQ31 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lpar3Q9EQ31 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lpar3Q9EQ31 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lpar3Q9EQ31 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lpar3Q9EQ31 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lpar3Q9EQ31 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lpar3Q9EQ31 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lpar3Q9EQ31 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lpar3Q9EQ31 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpar3Q9EQ31 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lpar3Q9EQ31 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lpar3Q9EQ31 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lpar3Q9EQ31 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lpar3Q9EQ31 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lpar3Q9EQ31 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lpar3Q9EQ31 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lpar3Q9EQ31 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lpar3Q9EQ31 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lpar3Q9EQ31 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lpar3Q9EQ31 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lpar3Q9EQ31 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lpar3Q9EQ31 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Lpar3Q9EQ31 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lpar3Q9EQ31 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lpar3Q9EQ31 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lpar3Q9EQ31 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lpar3Q9EQ31 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lpar3Q9EQ31 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lpar3Q9EQ31 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms