Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cxcr6Q9EQ16 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxcr6Q9EQ16 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxcr6Q9EQ16 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cxcr6Q9EQ16 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cxcr6Q9EQ16 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cxcr6Q9EQ16 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms