Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan4Q9DCK3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan4Q9DCK3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan4Q9DCK3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan4Q9DCK3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan4Q9DCK3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tspan4Q9DCK3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan4Q9DCK3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan4Q9DCK3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tspan4Q9DCK3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tspan4Q9DCK3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tspan4Q9DCK3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tspan4Q9DCK3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan4Q9DCK3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tspan4Q9DCK3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan4Q9DCK3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan4Q9DCK3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan4Q9DCK3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan4Q9DCK3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan4Q9DCK3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan4Q9DCK3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan4Q9DCK3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan4Q9DCK3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tspan4Q9DCK3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tspan4Q9DCK3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms