Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MNCb-2875Q9DCB3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MNCb-2875Q9DCB3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MNCb-2875Q9DCB3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
MNCb-2875Q9DCB3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MNCb-2875Q9DCB3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
MNCb-2875Q9DCB3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
MNCb-2875Q9DCB3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MNCb-2875Q9DCB3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
MNCb-2875Q9DCB3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
MNCb-2875Q9DCB3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
MNCb-2875Q9DCB3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
MNCb-2875Q9DCB3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MNCb-2875Q9DCB3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
MNCb-2875Q9DCB3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
MNCb-2875Q9DCB3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MNCb-2875Q9DCB3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MNCb-2875Q9DCB3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MNCb-2875Q9DCB3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MNCb-2875Q9DCB3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MNCb-2875Q9DCB3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MNCb-2875Q9DCB3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MNCb-2875Q9DCB3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MNCb-2875Q9DCB3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MNCb-2875Q9DCB3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms