Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Hmgn3Q9DCB1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Hmgn3Q9DCB1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Hmgn3Q9DCB1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23,23■■□□□ 1,31
Hmgn3Q9DCB1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Hmgn3Q9DCB1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Hmgn3Q9DCB1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Hmgn3Q9DCB1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Hmgn3Q9DCB1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23,14■■□□□ 1,3
Hmgn3Q9DCB1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23,1■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Hmgn3Q9DCB1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23,08■■□□□ 1,28
Hmgn3Q9DCB1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Hmgn3Q9DCB1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Hmgn3Q9DCB1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Hmgn3Q9DCB1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Hmgn3Q9DCB1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
Hmgn3Q9DCB1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Hmgn3Q9DCB1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Hmgn3Q9DCB1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Hmgn3Q9DCB1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Hmgn3Q9DCB1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Hmgn3Q9DCB1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23,03■■□□□ 1,28
Hmgn3Q9DCB1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Hmgn3Q9DCB1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Hmgn3Q9DCB1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22,95■■□□□ 1,26
Hmgn3Q9DCB1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Hmgn3Q9DCB1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Hmgn3Q9DCB1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Hmgn3Q9DCB1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Hmgn3Q9DCB1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Hmgn3Q9DCB1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Hmgn3Q9DCB1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Hmgn3Q9DCB1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Hmgn3Q9DCB1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Hmgn3Q9DCB1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Hmgn3Q9DCB1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Hmgn3Q9DCB1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Hmgn3Q9DCB1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Hmgn3Q9DCB1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
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