Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cpne8Q9DC53 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cpne8Q9DC53 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cpne8Q9DC53 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cpne8Q9DC53 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cpne8Q9DC53 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cpne8Q9DC53 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cpne8Q9DC53 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cpne8Q9DC53 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cpne8Q9DC53 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cpne8Q9DC53 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cpne8Q9DC53 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cpne8Q9DC53 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cpne8Q9DC53 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cpne8Q9DC53 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cpne8Q9DC53 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cpne8Q9DC53 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cpne8Q9DC53 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cpne8Q9DC53 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cpne8Q9DC53 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cpne8Q9DC53 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cpne8Q9DC53 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cpne8Q9DC53 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cpne8Q9DC53 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cpne8Q9DC53 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cpne8Q9DC53 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cpne8Q9DC53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cpne8Q9DC53 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cpne8Q9DC53 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cpne8Q9DC53 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpne8Q9DC53 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpne8Q9DC53 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpne8Q9DC53 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpne8Q9DC53 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpne8Q9DC53 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpne8Q9DC53 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpne8Q9DC53 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpne8Q9DC53 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpne8Q9DC53 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpne8Q9DC53 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpne8Q9DC53 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpne8Q9DC53 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cpne8Q9DC53 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cpne8Q9DC53 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cpne8Q9DC53 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cpne8Q9DC53 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cpne8Q9DC53 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cpne8Q9DC53 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpne8Q9DC53 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpne8Q9DC53 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cpne8Q9DC53 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cpne8Q9DC53 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms