Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmg20aQ9DC33 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmg20aQ9DC33 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hmg20aQ9DC33 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hmg20aQ9DC33 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hmg20aQ9DC33 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hmg20aQ9DC33 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hmg20aQ9DC33 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmg20aQ9DC33 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmg20aQ9DC33 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmg20aQ9DC33 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmg20aQ9DC33 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmg20aQ9DC33 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmg20aQ9DC33 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20aQ9DC33 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20aQ9DC33 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20aQ9DC33 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmg20aQ9DC33 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms