Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csnk1dQ9DC28 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csnk1dQ9DC28 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csnk1dQ9DC28 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csnk1dQ9DC28 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csnk1dQ9DC28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csnk1dQ9DC28 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csnk1dQ9DC28 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csnk1dQ9DC28 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Csnk1dQ9DC28 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Csnk1dQ9DC28 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Csnk1dQ9DC28 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Csnk1dQ9DC28 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Csnk1dQ9DC28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csnk1dQ9DC28 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csnk1dQ9DC28 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csnk1dQ9DC28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Csnk1dQ9DC28 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csnk1dQ9DC28 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Csnk1dQ9DC28 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csnk1dQ9DC28 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Csnk1dQ9DC28 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Csnk1dQ9DC28 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Csnk1dQ9DC28 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Csnk1dQ9DC28 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csnk1dQ9DC28 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csnk1dQ9DC28 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Csnk1dQ9DC28 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Csnk1dQ9DC28 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csnk1dQ9DC28 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csnk1dQ9DC28 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csnk1dQ9DC28 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csnk1dQ9DC28 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csnk1dQ9DC28 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Csnk1dQ9DC28 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csnk1dQ9DC28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csnk1dQ9DC28 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csnk1dQ9DC28 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csnk1dQ9DC28 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csnk1dQ9DC28 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csnk1dQ9DC28 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csnk1dQ9DC28 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csnk1dQ9DC28 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csnk1dQ9DC28 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csnk1dQ9DC28 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Csnk1dQ9DC28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Csnk1dQ9DC28 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csnk1dQ9DC28 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Csnk1dQ9DC28 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Csnk1dQ9DC28 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csnk1dQ9DC28 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csnk1dQ9DC28 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Csnk1dQ9DC28 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Csnk1dQ9DC28 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csnk1dQ9DC28 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csnk1dQ9DC28 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Csnk1dQ9DC28 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
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