Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR4

Apbb2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb2Q9DBR4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apbb2Q9DBR4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Apbb2Q9DBR4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apbb2Q9DBR4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apbb2Q9DBR4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apbb2Q9DBR4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apbb2Q9DBR4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apbb2Q9DBR4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Apbb2Q9DBR4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apbb2Q9DBR4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apbb2Q9DBR4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apbb2Q9DBR4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Apbb2Q9DBR4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apbb2Q9DBR4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apbb2Q9DBR4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apbb2Q9DBR4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apbb2Q9DBR4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Apbb2Q9DBR4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apbb2Q9DBR4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb2Q9DBR4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apbb2Q9DBR4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apbb2Q9DBR4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apbb2Q9DBR4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb2Q9DBR4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb2Q9DBR4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apbb2Q9DBR4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb2Q9DBR4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb2Q9DBR4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apbb2Q9DBR4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb2Q9DBR4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apbb2Q9DBR4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apbb2Q9DBR4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms