Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pop5Q9DB28 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pop5Q9DB28 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pop5Q9DB28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pop5Q9DB28 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pop5Q9DB28 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pop5Q9DB28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pop5Q9DB28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pop5Q9DB28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pop5Q9DB28 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pop5Q9DB28 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pop5Q9DB28 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pop5Q9DB28 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pop5Q9DB28 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pop5Q9DB28 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pop5Q9DB28 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pop5Q9DB28 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pop5Q9DB28 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pop5Q9DB28 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pop5Q9DB28 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pop5Q9DB28 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pop5Q9DB28 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pop5Q9DB28 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pop5Q9DB28 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pop5Q9DB28 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pop5Q9DB28 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pop5Q9DB28 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pop5Q9DB28 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pop5Q9DB28 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pop5Q9DB28 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pop5Q9DB28 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pop5Q9DB28 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pop5Q9DB28 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pop5Q9DB28 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pop5Q9DB28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pop5Q9DB28 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pop5Q9DB28 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pop5Q9DB28 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pop5Q9DB28 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pop5Q9DB28 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pop5Q9DB28 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pop5Q9DB28 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pop5Q9DB28 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pop5Q9DB28 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pop5Q9DB28 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pop5Q9DB28 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pop5Q9DB28 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pop5Q9DB28 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pop5Q9DB28 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pop5Q9DB28 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pop5Q9DB28 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pop5Q9DB28 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pop5Q9DB28 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
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