Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ift46Q9DB07 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift46Q9DB07 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift46Q9DB07 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift46Q9DB07 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ift46Q9DB07 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ift46Q9DB07 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift46Q9DB07 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ift46Q9DB07 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift46Q9DB07 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ift46Q9DB07 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift46Q9DB07 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift46Q9DB07 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ift46Q9DB07 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ift46Q9DB07 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ift46Q9DB07 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift46Q9DB07 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift46Q9DB07 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift46Q9DB07 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift46Q9DB07 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift46Q9DB07 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift46Q9DB07 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift46Q9DB07 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift46Q9DB07 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift46Q9DB07 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift46Q9DB07 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift46Q9DB07 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift46Q9DB07 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift46Q9DB07 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift46Q9DB07 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift46Q9DB07 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift46Q9DB07 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift46Q9DB07 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift46Q9DB07 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift46Q9DB07 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift46Q9DB07 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ift46Q9DB07 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ift46Q9DB07 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ift46Q9DB07 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift46Q9DB07 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ift46Q9DB07 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ift46Q9DB07 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift46Q9DB07 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ift46Q9DB07 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift46Q9DB07 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift46Q9DB07 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ift46Q9DB07 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift46Q9DB07 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift46Q9DB07 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift46Q9DB07 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift46Q9DB07 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ift46Q9DB07 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms