Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prpf4Q9DAW6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Prpf4Q9DAW6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf4Q9DAW6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Prpf4Q9DAW6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Prpf4Q9DAW6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Prpf4Q9DAW6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Prpf4Q9DAW6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf4Q9DAW6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf4Q9DAW6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Prpf4Q9DAW6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Prpf4Q9DAW6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Prpf4Q9DAW6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf4Q9DAW6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Prpf4Q9DAW6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prpf4Q9DAW6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prpf4Q9DAW6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Prpf4Q9DAW6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Prpf4Q9DAW6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Prpf4Q9DAW6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prpf4Q9DAW6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prpf4Q9DAW6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Prpf4Q9DAW6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf4Q9DAW6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf4Q9DAW6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Prpf4Q9DAW6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf4Q9DAW6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf4Q9DAW6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Prpf4Q9DAW6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Prpf4Q9DAW6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf4Q9DAW6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prpf4Q9DAW6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prpf4Q9DAW6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prpf4Q9DAW6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Prpf4Q9DAW6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prpf4Q9DAW6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Prpf4Q9DAW6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf4Q9DAW6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Prpf4Q9DAW6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prpf4Q9DAW6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prpf4Q9DAW6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Prpf4Q9DAW6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf4Q9DAW6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Prpf4Q9DAW6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Prpf4Q9DAW6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms